Detektion und Genotypisierung von Mykobakterien

Der VisionArray ® MYCO Chip 2.0 unserer Partnerfirma ZytoVision GmbH ist ein DNA-Array für den Nachweis von Mykobakterien. Der Chip detektiert den M. tuberculosis-Komplex und zahlreiche klinisch relevante, nicht-tuberkulöse Mykobakterium-Arten. Für den Nachweis von M. tuberculosis wird sowohl das für tuberkulöse Mykobakterien spezifische Insertionselement IS6110 verwendet als auch die 16S-23S rRNAITS (internal transcribed spacer)-Region. Die Detektion beruht auf einem bewährten und robusten biochemischen Nachweisverfahren. Spezifische PCR-Amplikons werden mit biotinylierten Primern generiert und mit dem MYCO Chip 2.0 hybridisiert. Sie binden dabei an komplementäre Fängersonden auf dem Array, unspezifische Bindungen werden durch stringentes Waschen aufgelöst. Anschließend wird ein Streptavidin-Peroxidase Enzym-Konjugat hinzugefügt, welches Tetramethylbenzidin (TMB) in einer blauen Farbreaktion umsetzt. Als interne Positivkontrolle gemäß WHOEmpfehlung dient das humane HLA-DQA1 Gen.
Das Auslesen der Signale erfolgt mit einem einfach zu bedienenden Scanner mit angeschlossenem Laptop, für die Datenanalyse steht eine intuitiv handhabbare Analyse-Software zur Verfügung.
Nach erfolgter PCR-Reaktion nehmen der Array-basierte Nachweis, das Scannen des Chips und die Datenanalyse insgesamt nur noch 60 Minuten in Anspruch. Mit dem VisionArray ® MYCO Chip 2.0 steht somit ein hochspezifisches, sensitives und robustes System zum Nachweis der wesentlichen, klinisch relevanten Mykobakterien-Arten zur Verfügung.