Next Generation Sequencing (NGS)
Library Präparation in nur einem Arbeitstag
Seit 2019 bieten wir Produkte unserer Partnerfirma AmoyDx® für das Next Generation Sequencing, NGS, an. Die Herstellung vieler AmoyDx® NGS-Libraries basiert auf dem HANDLE-Verfahren (Halo-shaped ANnealing and Defer-Ligation Enrichment). Dieses schnelle Protokoll besteht aus lediglich sechs Schritten und kann an nur einem Arbeitstag abgearbeitet werden. Alle Reaktionen finden in lediglich einem Tube pro Patienten-Probe statt.
Des Weiteren bieten wir Kits an, durch die mittels Hybrid-Capture Verfahren, dem sogenannten ddCAP-Verfahren (dual-directional capture technology) unbekannte Fusionspartner detektiert werden können.
Workflow HANDLE Library Präparation
Vorteile des AmoyDx®-HANDLE-NGS Kits
Library Präparation innerhalb eines Arbeitstages
geringer Arbeitsaufwand durch Library Präparation in nur sechs Schritten
nur eine PCR-Aufreinigung am Ende der Library Präparation erforderlich
Verwendung von UID-, unique identifier, Sequenzen zur effizienten Identifizierung von PCR-Fehlern während der Datenanalyse
Analyse auf der AmoyDx® ANDAS Workstation als unabhängiges lokales Stand-alone-System für hohe Datensicherheit
für viele gängige Illumina-Sequenzierplattformen geeignet
| Produkt | Hersteller | Menge | Format | Status | Best-Nr. | Info |
|---|---|---|---|---|---|---|
| AmoyDx® BRCA Pro Panel | AmoyDx | 1 Kit (24 Tests) | Bulk | CE/IVD | ADX-NBR04 | |
| AmoyDx® HANDLE Classic NGS Panel | AmoyDx | 1 Kit (24 Tests) | Bulk | CE/IVD | ADX-HCNP01 | |
| AmoyDx® HANDLE HRR NGS Panel | AmoyDx | 1 Kit (24 Tests) | Bulk | CE/IVD | ADX-HHNP02 | |
| AmoyDx® HANDLE Melanoma NGS Panel | AmoyDx | 1 Kit (24 Tests) | Bulk | RUO | ADX-HCUS-01-R | |
| AmoyDx® HRD Focus Panel | AmoyDx | 1 Kit (20 Tests) | Bulk | CE/IVD | ADX-HDNP03 | |
| AmoyDx® HRD Focus Panel | AmoyDx | 1 Kit (20 Tests) | Bulk | RUO | ADX-HDNP03-R | |
| AmoyDx® Myeloid Blood Cancer Panel | AmoyDx | 1 Kit (24 Tests) | Bulk | RUO | ADX-MBCP06-R | |
| AmoyDx® HRD Complete Panel | AmoyDx | 1 Kit (20 Tests) | Bulk | RUO | ADX-HCOM05-R |
Die AmoyDx®-ddCAP Kits (Hybrid Capture)
Das dual directional Capture (ddCAP) Verfahren von AmoyDx® umfasst ein zweitägiges Protokoll. Es basiert auf der Hybrid-Capture Technologie und hat somit den Vorteil, dass auch unbekannte Genfusionen detektiert werden können.
Vorteile der AmoyDx®-ddCAP Kits
Detektion von unbekannten Fusionspartnern
Verwendung von UID-Sequenzen (Unique Identifier Sequences) zur effizienten Identifizierung von PCR-Fehlern während der Datenanalyse
Analyse auf der ANDAS Workstation als unabhängiges lokales Stand-alone-System für hohe Datensicherheit
für viele gängige Illumina-Sequenzierplattformen geeignet
| Produkt | Hersteller | Menge | Format | Status | Best-Nr. | Info |
|---|---|---|---|---|---|---|
| AmoyDx® Comprehensive Panel | AmoyDx | 1 Kit (24 Tests) | Bulk | RUO | ADX-NCP04-R | |
| AmoyDx® Essential NGS Panel | AmoyDx | 1 Kit (24 Tests) | Bulk | CE/IVD | ADX-NLC01 |
Erfahren Sie mehr:
Der ANDAS-Analyseserver
Zur Analyse von Sequenzdaten, die mit AmoyDx® NGS Kits erzeugt wurden, bietet Zytomed Systems das AmoyDx® NGS Data Analysis System (ANDAS) unserer Partnerfirma AmoyDx® an. Das System besteht aus einer lokalen Workstation und darauf vorinstallierter ANDAS-Analysesoftware. Die Software enthält einzelne Module für die Auswertung der verschiedenen AmoyDx® NGS-Panels auf Basis mehrerer Sequenzdatenbanken. Die Analyse von Sequenzdaten wird damit schnell und einfach durchführbar.
Vorteile des ANDAS Systems
In einfachen Schritten von den Rohdaten der Sequenzierung zur klinischen Information
Übersichtliche Anzeige von wichtigen Qualitätsparametern, unter anderem Q30 (%), Alignmentrate oder effektive Sequenziertiefe, für jede Probe
Lokale Workstation als sichere Lösung für die Datenverarbeitung
Regelmäßige Updates der verwendeten Datenbanken
| Produkt | Hersteller | Menge | Format | Status | Best-Nr. | Info |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ANDAS Data Analyzer | AmoyDx | 1 Server System | - | CE/IVD | ANDAS-1 |
