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Next Generation Sequencing (NGS)

Library Präparation in nur einem Arbeitstag

Seit 2019 bieten wir Produkte unserer Partnerfirma AmoyDx® für das Next Generation Sequencing, NGS, an. Die Herstellung vieler AmoyDx® NGS-Libraries basiert auf dem HANDLE-Verfahren (Halo-shaped ANnealing and Defer-Ligation Enrichment). Dieses schnelle Protokoll besteht aus lediglich sechs Schritten und kann an nur einem Arbeitstag abgearbeitet werden. Alle Reaktionen finden in lediglich einem Tube pro Patienten-Probe statt.

Des Weiteren bieten wir Kits an, durch die mittels Hybrid-Capture Verfahren, dem sogenannten ddCAP-Verfahren (dual-directional capture technology) unbekannte Fusionspartner detektiert werden können.

Workflow HANDLE Library Präparation

Vorteile des AmoyDx®-HANDLE-NGS Kits

  • Library Präparation innerhalb eines Arbeitstages

  • geringer Arbeitsaufwand durch Library Präparation in nur sechs Schritten

  • nur eine PCR-Aufreinigung am Ende der Library Präparation erforderlich

  • Verwendung von UID-, unique identifier, Sequenzen zur effizienten Identifizierung von PCR-Fehlern während der Datenanalyse

  • Analyse auf der AmoyDx® ANDAS Workstation als unabhängiges lokales Stand-alone-System für hohe Datensicherheit

  • für viele gängige Illumina-Sequenzierplattformen geeignet

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Produkt Best-Nr.
AmoyDx® BRCA Pro Panel ADX-NBR04
AmoyDx® HANDLE Classic NGS Panel ADX-HCNP01
AmoyDx® HANDLE HRR NGS Panel ADX-HHNP02
AmoyDx® HANDLE Melanoma NGS Panel ADX-HCUS-01-R
AmoyDx® HRD Focus Panel ADX-HDNP03
AmoyDx® Myeloid Blood Cancer Panel ADX-MBCP06-R
AmoyDx® HRD Complete Panel ADX-HCOM05-R

Die AmoyDx®-ddCAP Kits (Hybrid Capture)

Das dual directional Capture (ddCAP) Verfahren von AmoyDx® umfasst ein zweitägiges Protokoll. Es basiert auf der Hybrid-Capture Technologie und hat somit den Vorteil, dass auch unbekannte Genfusionen detektiert werden können.

Vorteile der AmoyDx®-ddCAP Kits

  • Detektion von unbekannten Fusionspartnern

  • Verwendung von UID-Sequenzen (Unique Identifier Sequences) zur effizienten Identifizierung von PCR-Fehlern während der Datenanalyse

  • Analyse auf der ANDAS Workstation als unabhängiges lokales Stand-alone-System für hohe Datensicherheit

  • für viele gängige Illumina-Sequenzierplattformen geeignet

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Produkt Best-Nr.
AmoyDx® Comprehensive Panel ADX-NCP04-R
AmoyDx® Essential NGS Panel ADX-NLC01
AmoyDx® FGFR1-4 NGS Panel ADX-NFP08-R
AmoyDx® Master Panel ADX-NMP07-R

Der ANDAS-Analyseserver

Zur Analyse von Sequenzdaten, die mit AmoyDx® NGS Kits erzeugt wurden, bietet Zytomed Systems das AmoyDx® NGS Data Analysis System (ANDAS) unserer Partnerfirma AmoyDx® an. Das System besteht aus einer lokalen Workstation und darauf vorinstallierter ANDAS-Analysesoftware. Die Software enthält einzelne Module für die Auswertung der verschiedenen AmoyDx® NGS-Panels auf Basis mehrerer Sequenzdatenbanken. Die Analyse von Sequenzdaten wird damit schnell und einfach durchführbar.

Vorteile des ANDAS Systems

  • In einfachen Schritten von den Rohdaten der Sequenzierung zur klinischen Information

  • Übersichtliche Anzeige von wichtigen Qualitätsparametern, unter anderem Q30 (%), Alignmentrate oder effektive Sequenziertiefe, für jede Probe

  • Lokale Workstation als sichere Lösung für die Datenverarbeitung

  • Regelmäßige Updates der verwendeten Datenbanken

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Produkt Best-Nr.
ANDAS Data Analyzer ANDAS-1

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