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Next Generation Sequencing (NGS)

Library Präparation in nur einem Arbeitstag


Seit 2019 bieten wir Produkte unserer Partnerfirma AmoyDx® für das Next Generation Sequencing, NGS, an. Die Herstellung vieler AmoyDx® NGS-Libraries basiert auf dem HANDLE-Verfahren (Halo-shaped ANnealing and Defer-Ligation Enrichment). Dieses schnelle Protokoll besteht aus lediglich sechs Schritten und kann an nur einem Arbeitstag abgearbeitet werden. Alle Reaktionen finden in lediglich einem Tube pro Patienten-Probe statt.

Des Weiteren bieten wir Kits an, durch die mittels Hybrid-Capture Verfahren, dem sogenannten ddCAP-Verfahren (dual-directional capture technology) unbekannte Fusionspartner detektiert werden können.


Workflow HANDLE Library Preparation

Advantages of the AmoyDx® HANDLE NGS kitsLibrary preparation within only one working day

  • Low work effort through library preparation in only 6 steps

  • One single PCR purification step required

  • UID-sequences (unique identifier sequences) efficiently identify PCR errors during data analysis

  • Sequencing data analysis on the AmoyDx® ANDAS workstation, a cloud-independent stand-alone system for high data security

  • Suitable for many common Illumina sequencing platforms

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Produkt Menge Preis
AmoyDx® BRCA Pro Panel 1 Kit (24 Tests) -
AmoyDx® BRCA Pro Panel 1 Kit (24 Tests) -
AmoyDx® HANDLE Classic NGS Panel 1 Kit (24 Tests) -
AmoyDx® HANDLE Classic NGS Panel 1 Kit (24 Tests) -
AmoyDx® HANDLE HRR NGS Panel 1 Kit (24 Tests) -
AmoyDx® HRD Focus Panel 1 Kit (20 Tests) -
AmoyDx® HRD Focus Panel 1 Kit (20 Tests) -

Die AmoyDx®-ddCAP Kits (Hybrid Capture)

Das dual directional Capture (ddCAP) Verfahren von AmoyDx® umfasst ein zweitägiges Protokoll. Es basiert auf der Hybrid-Capture Technologie und hat somit den Vorteil, dass auch unbekannte Genfusionen detektiert werden können.

Vorteile der AmoyDx®-ddCAP Kits

  • Detektion von unbekannten Fusionspartnern

  • Verwendung von UID-Sequenzen (Unique Identifier Sequences) zur effizienten Identifizierung von PCR-Fehlern während der Datenanalyse

  • Analyse auf der ANDAS Workstation als unabhängiges lokales Stand-alone-System für hohe Datensicherheit

  • für viele gängige Illumina-Sequenzierplattformen geeignet

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Produkt Menge Preis
AmoyDx® Comprehensive Panel 1 Kit (24 Tests) -
AmoyDx® Essential NGS Panel 1 Kit (24 Tests) -
AmoyDx® Essential NGS Panel 1 Kit (24 Tests) -

Der ANDAS-Analyseserver

Zur Analyse von Sequenzdaten, die mit AmoyDx® NGS Kits erzeugt wurden, bietet Zytomed Systems das AmoyDx® NGS Data Analysis System (ANDAS) unserer Partnerfirma AmoyDx® an. Das System besteht aus einer lokalen Workstation und darauf vorinstallierter ANDAS-Analysesoftware. Die Software enthält einzelne Module für die Auswertung der verschiedenen AmoyDx® NGS-Panels auf Basis mehrerer Sequenzdatenbanken. Die Analyse von Sequenzdaten wird damit schnell und einfach durchführbar.

Vorteile des ANDAS Systems

  • In einfachen Schritten von den Rohdaten der Sequenzierung zur klinischen Information

  • Übersichtliche Anzeige von wichtigen Qualitätsparametern, unter anderem Q30 (%), Alignmentrate oder effektive Sequenziertiefe, für jede Probe

  • Lokale Workstation als sichere Lösung für die Datenverarbeitung

  • Regelmäßige Updates der verwendeten Datenbanken

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ANDAS Data Analyzer 1 Server System -